Dominiks relativt milde framgangsmåte mot de sydfranske kjetterne ga ingen stor suksess, og etter hans død i 1221 ble inkvisisjonen innført og tortur og dødsdommer vanlige. Dominikanerne fikk ansvaret for inkvisisjonen, og deres svarte og hvite kutter slo mange med skrekk. Filmen Rosens navn gir et ikke helt etterrettelig, men likevel slående bilde av forholdene.
Det viktige med dominikanerne var imidlertid deres intellektuelle preg. De var topp utdannede teologer og ble snart dominerende ved de nye universitetene på 1200-tallet. Særlig i Paris, ved det teologiske fakultetet, var de den ledende ordenen. Blant kjente dominikanere er naturligvis først og fremst Thomas Aquinas, men også Dietrich fra Freiberg og Meister Eckhart tilhørte ordenen. Av senere, kontroversielle dominikanere har vi Giordano Bruno og Tommaso Campanella.